Willi Meier ist verheiratet und hat zwei erwachsene Töchter. Er studierte Mathematik und Physik an der ETH Zürich, wo er 1975 promovierte. Bis 1984 forschte er an der ETH und an den Universitäten Oxford, Heidelberg und Siegen auf einem Gebiet der Reinen Mathematik. Von 1984 bis 1985 war er kurzzeitig Versicherungsmathematiker bei der Union Rück in Zürich. Seit 1985 ist er Dozent für Mathematik und Informatik an der FHNW in Windisch. Dort betreibt er neben dem Unterricht Forschung auf dem Gebiet der Kryptologie.