Johannes Trüper setzte mit seiner Arbeit auf der Sophienhöhe in Jena einen Meilenstein in der Geschichte der Heilerziehung. Durch sein fortschrittliches Denken, sein breit gefächertes Wissen und seinen Tatendrang gelang es ihm, die Medizin und die Pädagogik in der Heilerziehung zu verbinden und damit bei den ihm anvertrauten Kindern einzigartige Erfolge zu erzielen. Dabei stieß er jedoch nicht nur auf Gegenliebe: Harte Auseinandersetzungen mit konventionellen Medizinern erschweren ihm immer wieder die Arbeit.